El CONICET mantiene vínculos de Cooperación con las siguientes instituciones:
ALEMANIA
- AWI – Alfred Wegener Institute for Polar and Marine Research
- BAYLAT – Centro Universitario de Baviera para América Latina
- BKG – Federal Agency for Cartography and Geodesy
- DAAD – German Academic Exchange Service
- DFG – German Research Foundation
- GFZ – German Research Centre for Geosciences
- MPG – Sociedad Max Planck
- UFZ– Helmholtz Centre for Environmental Research
AUSTRIA
- FWF – Austrian Science Fund
BÉLGICA
- FNRS – Fonds National de la Recherche Scientifique
- FWO – Research Foundation Flanders
BRASIL
- CNPq – Conselho Nacional de Desenvolvimiento Científico e Tecnológico
- CNPEM – Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiai
- FAPESP – Fundação de Amparo da Pesquisa do Estado de são Paulo
- FAPERJ – Fundação de Amparo da Pesquisa do Estado de Rio de Janeiro
- LNLS: Laboratório Nacional de Luz Sincrotron
CANADÁ
Cooperación con International Development Research Centre (IDRC) en proyectos puntuales ofrecidos por esta institución en Latinoamérica.
CHILE
- CONICYT – Comisión Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
CHINA
- CAS – Chinese Academy of Sciences
- NAOC – National Astronomical Observatory of China
- NSFC – National Natural Science Foundation of China
COLOMBIA
- COLCIENCIAS – Fondo Colombiano de Investigaciones Científicas y Proyectos Especiales “Francisco José de Caldas”
COREA
- NRF – National Research Foundation
ESLOVAQUIA
- SAS – Academia de Ciencias de Eslovaquia
ESPAÑA
- CSIC: Consejo Superior de Investigaciones Científicas
ESTADOS UNIDOS
- National Science Foundation (NSF)
- National Institute of Health (NIH)
FRANCIA
- CNRS – Centre National de la Recherche Scientifique
- INSERM – Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
- Université Paris Diderot – Paris 7
- Université Paris Sorbonne Cité
GRAN BRETAÑA
- The Royal Society
- BBSRC
INDIA
- CSIR – Council of Scientific and Industrial Research
ITALIA
- CNR – Consiglio Nazionale delle Ricerche
- CUIA – Consorcio Interuniversitario Italiano para Argentina
JAPÓN
- JSPS: Japan Society for the Promotion of Science
- JICA: Agencia de Cooperación Internacional del Japón
MALASIA
- Universidad Tecnológica de Malasia
MÉXICO
- CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología
POLONIA
- PAN – Academia Polaca de Ciencias
REPÚBLICA CHECA
- CAS – Czech Academy of Sciences
RUSIA
- Academia de Ciencias Rusa
SUIZA
- SNSF – Swiss National Science Foundation
URUGUAY
- ANII: Agencia Nacional de Investigación e Innovación